9条线路涉及龙岗、光明、宝安、南山、大鹏、福田、罗湖7个区，大鹏溪涌将有直通地铁。随着规划批复，未来深圳将有20号、11号、13号、6号线4条地铁同时与东莞地铁衔接。
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3号线四期
工程调整为地下敷设方式，线路长度9.35公里（地下线7.42公里、地上线1.93公里）。建设工期5年。
6号线支线二期
工程自翠湖站（原荔林站）至光明城站，线路长度4.9公里（地下线4.25公里、地上线0.65公里）。建设工期4年。（深圳6号线支线建成后，将联通东莞1号线）
12号线二期
工程自海上田园东站至松岗站，线路长度8.16公里，为地下线。建设工期5年。
13号线二期（含北延、南延）
北延段
北延段自上屋站至公明北站，线路长度18.8公里，为地下线。建设工期5年。（东莞松山湖片区的5号线南端计划与深圳13号线衔接，延伸至深圳13号线公明北站）
南延段
南延段自深圳湾口岸站至东角头站，线路长度4.47公里，为地下线。建设工期5年。
16号线二期
工程自大运站至西坑站，线路长度9.53公里，为地下线。建设工期5年。
7号线二期
工程自西丽湖站至学府医院站，线路长度2.45公里，为地下线。建设工期4年。
8号线三期
工程自小梅沙站至溪涌站，线路长度4.26公里，为地下线。建设工期5年。
11号线二期
工程自福田站至红岭南站，线路长度5.58公里，为地下线。建设工期4年。（深圳地铁11号线将与东莞3号线连接）
20号线一期
工程自会议中心站至机场北站，长8.43公里，为地下线。建设工期3年。（20号线定位是支撑大空港、T4枢纽，将加强与东莞长安新区联系。远期预留至东莞2号线的条件）
本版图表：温亮
