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用DNA克隆塑料兔子? 科学家做到了!

来源:羊城晚报     2019年12月14日        版次:A10    作者:克莉斯汀

     塑料兔子被植入了DNA信息,并不代表它有了生命 (资料截图)

     斯坦福兔子

  □克莉斯汀

  爱因斯坦的母校——瑞士苏黎世联邦理工学院(前身是苏黎世工业大学)和以色列Erlich Lab最近公布了一项神奇的研究,他们首次将DNA作为信息存储工具,注入到了日常物品当中,比如一只塑料兔子身上,然后只需要切下这只塑料兔子身体上的任何一小部分,就可以用3D打印机重塑一只一模一样的塑料兔子出来,而且是想打印多少只都可以一模一样。

  莫非这只塑料兔子也拥有了自己的DNA?这实在是件令人惊奇的事。发表在《Nature》(专业期刊《自然》)的子刊《自然生物技术》上的相关论文中,科学家指出,他们做这样的尝试目的其实是致力于将DNA数据存储的概念提升到前所未有的高度——DNA存储量相当大,远超过硬盘、磁带等电子设备,或许未来只需要一小盒子的DNA就可以保存下整个地球上所有生命体的遗传信息。

  目前这项研究起码证明了一点:DNA真的能实现无处不在的存储。

  一只拥有DNA信息的塑料兔子

  这只3D兔子是在苏黎世联邦理工学院的实验室中被打印出来的,之所以选择了兔子,只是因为它是一个非常常用的计算机图形三维测试模型,这只兔子还有个名字叫斯坦福兔。

  打印它所使用的材料,是一种特殊的聚合物基质——可以这么理解,这种材料经过高浓度压缩被注入了DNA信息,然后重新聚合,就像数以万计的微小玻璃珠聚合到一起,组成了这只兔子,而每一颗珠子都包含着几十个合成DNA分子。

  研究人员采用的是一个叫DoT(DNA of Things)的架构。正是在这种架构中,DNA分子被融合到一种功能性材料中,从而创建出具有不可变内存的对象。这样,用这种材料打印出来的物件就可以拥有自己的DNA信息了。也就是说,不管是兔子还是什么其他任何没有生命的物件在这种技术重造之下,都可以有独特的DNA信息,这些信息里包括了几乎任何种类物件的所有数字信息。

  研究人员在实验过程中,就从这只塑料兔子的耳朵上剪下了约10mg的材料,仅占这只兔子总重量(3.2g)的0.3%,然后通过DoT架构进行了五代复制实验,第四代和第五代之间隔了9个月的时间,打印出的兔子依然保存着第一代兔子的所有信息,这也就表明这只塑料兔子的确具有长期存储DNA的能力。

  1公斤DNA就能存储全球数据

  用DNA来存储信息,目前来说其实已经是比较成熟的技术了。DNA用自身的4种碱基对:A-T、T-A、C-G、G-C,来编码遗传信息,用CRISPR基因编辑技术,已可以制造出任何DNA序列,存储相应的数据。

  而DNA存储的好处在于,它的存储密度要远超过硬盘、磁带等电子设备,1克DNA就足以存下海量信息。根据美国哈佛大学此前的研究,装满一鞋盒的DNA(约1kg)就能存储下全球数据。据说到目前为止,也只有DNA存储这类分子存储技术,在宏观上不会被几何形状所限制。DNA还非常稳定,能存在成百上千年,而只需要进行DNA测序,就可以读取这些信息。

  论文作者Erlich说,在物体中注入存储信息的DNA,未来还可以用于制造能够自我复制的机器人。事实上,这项技术还有更多不可思议的可能,包括医学方面的应用。比如,哈佛大学的研究人员尝试过把一张骑马的动画图,插到了大肠杆菌的DNA里。然后,他们对细菌的基因组进行测序,以重建图像,准确率达到了90%。

  去年,法国的一名高中生曾经把《圣经》和《古兰经》的一部分内容用DNA链编码,然后用AAV2病毒当载体注入自己的身体;今年6月,美国一家初创公司Catalog也尝试把16GB大小的英文维基百科内容编码在了DNA链上;7月,Catalog又宣布成功把1TB数据存到了重量仅以克计的DNA上,并且表示明年就会开始商业化。

  实用难题是如何降低成本

  不过目前DNA数据存储的另一大挑战,还是高昂的成本。无论是DNA合成还是DNA写入,现在都花费巨大。据维基百科介绍,每兆字节的编码成本为12400美元,检索成本为220美元。

  但相信不久的未来,这种成本难题还是可以被克服的。论文作者Erlich便说,如果批量生产,肯定会大大降低成本。因此有人指出,或许到2023年,这项技术在长期数据存储方面就能具有成本效益了。

  也许,若干年后的考古学家可以通过一个旧瓶子的碎片,就能轻易复原一个一模一样的完整的瓶子。更为神奇的是,如果在这个碎片中被存入过更多信息,后人甚至能从中还原出当下的整个文明全貌。